过了几年，欧雷、卡洛斯、波克兰帝斯、与丰缘、伽勒尔、合众签订互不侵犯条约。
次年春天晚上，欧雷对湛蓝市发动突袭，随后在满金市和浅葱市发动侵略战争，世界大战正式开始。
次日早上，欧雷、卡洛斯退出地区联盟，安德夫下令轰炸地区联盟总部，地区联盟解散，同时期卡洛斯向帕底亚宣战。
欧雷军队以惊人的速度，征服了城都，并迅速占领了关都大陆，并使用制导导弹逼迫关都宝可梦联盟投降，关都的宝可梦联盟决定投降，并迁移到七之岛和橘子群岛中（类似维系法国）。
同时帕底亚被卡洛斯占领，成为卡洛斯属帕底亚，莎莉娜被封为帝国元帅。
合众高层对此展开议论，觉得已经签订互不侵犯条约，外面的事情跟自己完全没有关系。
希洛觉得这样没有意义，于是自己上去，直接篡位，成为了合众地区的最高领导人，并宣布合众转换被战时经济，进行总动员，以面对轴心同盟的侵略，还顺带来了一场大清洗，将所有反对自己阻止轴心同盟的人全部处死。
面对关都几乎无损失海军，由于关都宝可梦联盟打算骑墙，希洛制定了类似弩炮计划的行动，关都海军的家底几乎全部打没，向世界证明自己反轴心同盟的决心。
由于波克兰帝斯表现的太拉，连个菲蕾都打不过，欧雷于是去给擦屁股，并一路占领北上乡、菲蕾、阿尔米亚，并直取神奥，奥卜利比亚宣布加入轴心同盟，与欧雷、波克兰帝斯一起进攻神奥。
奥卜利比亚正式成为波克兰帝斯的附属地区，同时期，卡洛斯对坚铁宣战。
合众马上派出远征军支援神奥，最后阿尔宙斯都上场，最后欧雷打光一半制导导弹库存，打败了阿尔宙斯，成功占领神奥，合众军队上演了一个宝可梦版的敦刻尔克大撤退。
合众军队和神奥流亡势力直接没了一半，神奥在合众建立了流亡政府，波克兰帝斯成为了欧雷的小弟（类似德国和意大利的关系），麦克被封为帝国元帅。
面对卡洛斯的攻势，坚铁宣布投降，加入了轴心同盟，并成为卡洛斯的附庸。
欧雷接下来征服阿罗拉，希洛也是派出远征军，面对光辉大神，欧雷把剩余的库存也和拿了出来，光辉大神战败，欧雷再次赢得胜利。
卡洛斯进军伽勒尔附近的蓝蒂尔地区，该地区为非军事地区，伽勒尔表示默许，最后卡洛斯成功占领了蓝蒂尔地区。
最后阿罗拉战场也是溃败，阿罗拉被占领，虽然神奥战场和阿罗拉战场溃败，但也是积累和许多和欧雷军队作战的经验。
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伽勒尔与轴心同盟达成协定，给予轴心同盟军事通行权和驻港权，同时对合众暗地里保证，如果合众能打出一场胜仗，伽勒尔会对轴心同盟宣战，并对合众送一些宝可梦和道具来支援，也是骑墙。
不过从外界来看，伽勒尔这是有可能加入轴心同盟，现在除合众的全世界人民都认为安德夫发明的意识形态是这个世界的最终道路，是历史发展的必然。
被占领的地区为了别被轴心同盟的人压迫的太惨，于是或多或少都会公开支持轴心同盟。
随后欧雷撕毁互不侵犯条约，对丰缘发动侵略战争，由于欧雷打的太厉害，丰缘直接沦陷，并在丰缘发动了大屠杀，打算对丰缘进行种族灭绝，随后对合众宣战。
由于欧雷过于丧心病狂，成为帝国元帅的莎莉娜看不下去了，于是进谏打算阻止欧雷的行为，结果被关禁闭了，莎莉娜打算效仿希洛，来一场篡位，并提前联系了希洛，希洛表示收到。
希洛发布演讲来振奋士气，表示现在全世界现在只剩下合众一个阵营，要保卫家园，必须拿起武器反抗，
随后卡洛斯先占领青海波市，对合众宣战，等待卡洛斯陆军到来，欧雷作为同盟进行支援。
希洛觉得欧雷优先解决，于是与欧雷进行作战，海军部队与部分陆军在杰克罗拉群岛进行战争，最后丢了杰克罗拉群岛，但欧雷海军部队受到重创，损失7成。
随后到了合众大陆，双方在吹寄市发动了大决战，卡洛斯军队都不管了，直接任由他们入侵，最后合众艰难守住本土，麦克和克劳德被当场杀死，欧雷陆军和空军损失8成。
波克兰帝斯打算变为中立，安德夫马上对波克兰帝斯进行占领，同时将波克兰帝斯灭族。
伽勒尔首领丹帝立即宣布与合众共进退，莎莉娜篡位成功，宣布退出轴心同盟，与希洛联合，将杰克罗拉群岛和卡洛斯占领区还给合众，并对欧雷这种残暴的民族表示嗤之以鼻，并解放全部占领地区。
随后开始不断的进行解放战争、阿罗拉、北上乡、神奥、菲蕾、阿尔米亚、关都、城都、丰缘被解放，奥卜利比亚领导的尸体被倒吊示众。
安德夫见兵力不是优势，占领的地区又被解放，宣布无条件投降，愿意接受审判。
不过审判过程是真的让希洛麻了，安德夫对除合众以外的地区放出消息，绥靖自己侵略行为和支持自己和自己所创造的意识形态，按照战争法都是战犯，要是不想自己被倒吊示众，必须帮全部欧雷军人脱罪。
因此，除了合众，其他地区代表都在和稀泥，整个审判过程是一团乱麻，最后一个欧雷战犯没有被审判，给希洛气的，直接来了一个元首的愤怒，把所有地区的领导层都给骂了一边。
现在没有一个地区被打的根本不能继续打下去了，欧雷被安德夫改造的整个地区都是马奇诺防线，只能硬冲，几乎有来无回。
最后希洛决定加入维和部队，并决定亲自上场，并说谁愿意加入这场战争，陆陆续续有人加入维和部队。
然后希洛带着临时凑的一个也就50人的队伍，去欧雷进行反恐行动，将安德夫的军阀势力铲除，轴心同盟彻底被铲除，世界重归和平。
——本书完结。