就在他们陷入困境时，艾丽突然想到了一个办法。她利用宇宙本源之力，制造出了一个强大的能量旋涡，将神秘组织的守卫部队吸了进去。趁着这个机会，艾丽等人迅速逃离了基地。

回到基地后，艾丽将在神秘组织基地获取的情报告诉了科研团队。科研团队对混沌晶核的信息非常感兴趣，他们立刻展开了研究。

经过一番研究，科研人员发现混沌晶核确实蕴含着巨大的能量，但这种能量非常不稳定，难以控制。如果强行利用，可能会引发巨大的灾难。

“我们必须找到一种方法，既能利用混沌晶核的能量，又能确保安全。”科研团队的负责人说道。

艾丽陷入了沉思，她知道，这是一个艰难的抉择。如果选择利用混沌晶核的能量，可能会在与神秘组织的较量中占据上风，但也可能会带来无法预料的后果；如果放弃，他们又将面临神秘组织的巨大压力。

在经过一番深思熟虑后，艾丽决定召集基地内的所有成员，召开一次全体大会。在大会上，她将目前的情况和面临的抉择告诉了大家。

“这是一个关乎我们生死存亡的决定，也是一个关乎宇宙命运的决定。我希望大家能够认真思考，然后我们一起做出选择。”艾丽说道。

大会上，大家展开了激烈的讨论。有人支持利用混沌晶核的能量，认为这是唯一能够击败神秘组织的方法；有人则反对，担心会引发不可挽回的灾难。

经过长时间的讨论和权衡，最终，艾丽做出了决定。“我们不能轻易放弃利用混沌晶核的能量，但我们必须确保安全。科研团队要集中所有力量，研究如何安全地利用混沌晶核；同时，我们要加强与其他宇宙文明的联系，共同应对可能出现的危机。”

在做出决定后，基地内再次忙碌起来。科研团队全力投入到对混沌晶核的研究中，他们不断进行实验和模拟，试图找到一种安全的利用方法；艾丽则带领外交团队，前往各个宇宙文明，寻求合作与支援。

在与其他宇宙文明的交流中，艾丽发现，许多文明都对宇宙本源之力和混沌晶核有所了解。他们纷纷表示愿意提供帮助，共同对抗神秘组织。

在各方的共同努力下，科研团队终于取得了重大突破。他们成功研发出了一种能够稳定控制混沌晶核能量的装置，这种装置可以将混沌晶核的能量转化为可利用的能源，用于武器和防御系统。

艾丽得知这个消息后，心中充满了喜悦和希望。她知道，他们离击败神秘组织又近了一步。在接下来的日子里，基地开始全面升级武器和防御系统，利用混沌晶核的能量，打造出了一支更加强大的舰队。而艾丽也在积极筹备着与神秘组织的最终对决，她相信，只要团结一心，他们一定能够守护好宇宙的和平与安宁，解开宇宙中更多的奥秘，迎接一个全新的未来。