建安三年（198年）春正月，曹操以汉献帝名义设置军师祭酒。

曹操表奏朝廷，任命郭嘉为司空军师祭酒。其定位为首席军事参谋、幕府核心智囊，高于一般军谋掾，低于军师。

军师祭酒的核心职能是参与最高军事会议，定战略、出奇计，掌机密文书、军情分析、局势预判，兼管军中司法、刑狱。

军师祭酒无固定编制，曹操可随时增置，广纳人才。

自此，曹操以三公之司空加行车骑将军身份，把司空府改造为了军事决策中心的军府，形成了“霸府政治”。

名义上，军府仍属汉廷三公府，合法合规。

但实际上是曹操的私人决策中枢，完全架空汉廷中央。

军府的核心架构，军事参谋线为：

尚书令荀彧。总揽内政、后勤、人才。

军师荀攸。最高参谋，总掌军国大计、刑狱法制。

军师祭酒郭嘉。首席谋士、军机核心，直接参与战略决策。

军谋掾、参军。高级参谋，分掌专项谋划。

长史、司马。军府日常行政、军务总管。

诸曹掾属。分掌民政、司法、经济、屯田等，代行朝廷九卿职权。

军府制度与汉制的区别在于：

军府官员多由曹操直接征辟，非朝廷任命，形成“府君与幕僚”的君臣关系 。